我們建構一個基於量子化學計算的生化官能基分子間作用位能資料庫。此類資料庫對於目前生化系統之分子模擬有著迫切的需要性。第一部分著重於量子化學計算對於雙分子作用力能量之取得。第二部分利用微擾理論建立官能基團之間的初步粗粒化。有了這些資料之後,第三部分建構粗粒化分子力場及進行高分子系統之動力學模擬。此一完整計算程序可以系統化並且提供大尺度模擬重要的輸入資訊。(應力所趙聖德教授提供) 圖一 烷、烯、炔(色散能主導)常見的官能基分子二聚體的構型 圖二 醇、醛、酮(氫鍵主導)常見的官能基分子二聚體的構型 圖三 酸、醯胺(靜電能主導)常見的官能基分子二聚體的構型
我們建構一個基於量子化學計算的生化官能基分子間作用位能資料庫。此類資料庫對於目前生化系統之分子模擬有著迫切的需要性。第一部分著重於量子化學計算對於雙分子作用力能量之取得。第二部分利用微擾理論建立官能基團之間的初步粗粒化。有了這些資料之後,第三部分建構粗粒化分子力場及進行高分子系統之動力學模擬。此一完整計算程序可以系統化並且提供大尺度模擬重要的輸入資訊。(應力所趙聖德教授提供)
圖一 烷、烯、炔(色散能主導)常見的官能基分子二聚體的構型
圖二 醇、醛、酮(氫鍵主導)常見的官能基分子二聚體的構型
圖三 酸、醯胺(靜電能主導)常見的官能基分子二聚體的構型